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わかりやすく言うと、エンジンの排気量アップです。

スクーターのエンジンの排気量は一般的に 50cc ( 原付二種で 90cc ) などですが、これをより大きな排気量のエンジンに交換するか、パーツを交換して排気量をアップすれば当然速度はアップします。

ちなみに、エンジン自体の交換は スワップ と言われ、パーツを交換するのが ボアアップ です。
ボアアップで交換するパーツは、ピストンとシリンダーです。

ただし、この作業には重大な欠点があります。
原付免許 をもっていて 50cc のスクーターに乗っている人が、そのままの免許で 70cc や 90cc などに変更すると、当然、無免許運転 となります。
また、実際の作業の注意としては、キャブセッティングやマフラー交換などの総合的なセッティングも必要となります。